MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 plasmid pTGRD1 DNA

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NS_000192	A	6	6	32	37	100 %	0 %	0 %	0 %	189485766
2	NS_000192	AT	3	6	86	91	50 %	50 %	0 %	0 %	189485766
3	NS_000192	TTG	2	6	209	214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485766
4	NS_000192	TAA	2	6	269	274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485766
5	NS_000192	A	8	8	273	280	100 %	0 %	0 %	0 %	189485766
6	NS_000192	A	6	6	349	354	100 %	0 %	0 %	0 %	189485766
7	NS_000192	GAAATA	2	12	355	366	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485766
8	NS_000192	TAA	2	6	422	427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485766
9	NS_000192	A	6	6	477	482	100 %	0 %	0 %	0 %	189485766
10	NS_000192	AAC	3	9	585	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485766
11	NS_000192	TTGC	2	8	607	614	0 %	50 %	25 %	25 %	189485766
12	NS_000192	AT	3	6	623	628	50 %	50 %	0 %	0 %	189485766
13	NS_000192	TAC	2	6	681	686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485766
14	NS_000192	GA	3	6	690	695	50 %	0 %	50 %	0 %	189485766
15	NS_000192	A	7	7	702	708	100 %	0 %	0 %	0 %	189485766
16	NS_000192	A	6	6	755	760	100 %	0 %	0 %	0 %	189485766
17	NS_000192	AAG	2	6	803	808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485766
18	NS_000192	ACG	2	6	830	835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485766
19	NS_000192	AGA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485766
20	NS_000192	TGCTA	2	10	998	1007	20 %	40 %	20 %	20 %	189485766
21	NS_000192	AAT	2	6	1017	1022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485766
22	NS_000192	AT	3	6	1046	1051	50 %	50 %	0 %	0 %	189485766
23	NS_000192	ACA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485766
24	NS_000192	TTA	2	6	1252	1257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485766
25	NS_000192	TGTTT	2	10	2290	2299	0 %	80 %	20 %	0 %	189485767
26	NS_000192	TGC	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485767
27	NS_000192	CCT	3	9	2398	2406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189485767
28	NS_000192	TA	3	6	2511	2516	50 %	50 %	0 %	0 %	189485767
29	NS_000192	TGT	2	6	2524	2529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485767
30	NS_000192	TAG	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485767
31	NS_000192	A	8	8	3185	3192	100 %	0 %	0 %	0 %	189485768
32	NS_000192	A	6	6	3201	3206	100 %	0 %	0 %	0 %	189485768
33	NS_000192	CAG	2	6	3306	3311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485768
34	NS_000192	ATA	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485768
35	NS_000192	AAT	2	6	3344	3349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485768
36	NS_000192	A	7	7	3365	3371	100 %	0 %	0 %	0 %	189485768
37	NS_000192	GTT	2	6	3396	3401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485768
38	NS_000192	CAA	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485768
39	NS_000192	CAG	2	6	3615	3620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485768
40	NS_000192	ACA	2	6	3644	3649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485768
41	NS_000192	TCAAT	2	10	3710	3719	40 %	40 %	0 %	20 %	189485768
42	NS_000192	ACA	2	6	3752	3757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485768
43	NS_000192	CAA	3	9	3816	3824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485768
44	NS_000192	CAACTA	2	12	3843	3854	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	189485768
45	NS_000192	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	189485769
46	NS_000192	TAT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485769
47	NS_000192	CTG	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485769
48	NS_000192	TTG	2	6	4169	4174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485769
49	NS_000192	TATT	2	8	4187	4194	25 %	75 %	0 %	0 %	189485769
50	NS_000192	T	6	6	4201	4206	0 %	100 %	0 %	0 %	189485769
51	NS_000192	TCG	2	6	4222	4227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485769
52	NS_000192	TGG	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189485769
53	NS_000192	ATA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485769
54	NS_000192	A	6	6	4301	4306	100 %	0 %	0 %	0 %	189485769
55	NS_000192	TGT	2	6	4345	4350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485769
56	NS_000192	CGTTT	2	10	4359	4368	0 %	60 %	20 %	20 %	189485769
57	NS_000192	TGT	2	6	4384	4389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485769
58	NS_000192	AAT	2	6	4391	4396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485769
59	NS_000192	A	8	8	7360	7367	100 %	0 %	0 %	0 %	189485770
60	NS_000192	A	6	6	7376	7381	100 %	0 %	0 %	0 %	189485770
61	NS_000192	CAG	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485770
62	NS_000192	TAA	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485770
63	NS_000192	AAT	2	6	7519	7524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485770
64	NS_000192	TAATGG	2	12	7576	7587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485770
65	NS_000192	GAA	2	6	7631	7636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485770
66	NS_000192	TGT	2	6	7726	7731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485770
67	NS_000192	AGT	2	6	7732	7737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485770
68	NS_000192	ACC	2	6	7801	7806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
69	NS_000192	ACC	2	6	7825	7830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
70	NS_000192	ACC	2	6	7849	7854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
71	NS_000192	ACC	2	6	7873	7878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
72	NS_000192	ACC	2	6	7897	7902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
73	NS_000192	ACC	2	6	7921	7926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
74	NS_000192	ACC	2	6	7945	7950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
75	NS_000192	ACC	2	6	7969	7974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
76	NS_000192	CTA	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485770
77	NS_000192	ACT	2	6	8002	8007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485770
78	NS_000192	ACA	2	6	8053	8058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
79	NS_000192	CAACAG	2	12	8063	8074	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189485770
80	NS_000192	AGA	2	6	8083	8088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485770
81	NS_000192	CGC	2	6	8119	8124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189485770
82	NS_000192	GATGT	2	10	8150	8159	20 %	40 %	40 %	0 %	189485770
83	NS_000192	AAC	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
84	NS_000192	CACAAG	2	12	8241	8252	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189485770
85	NS_000192	AAC	2	6	8253	8258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
86	NS_000192	TAC	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485770
87	NS_000192	AAGA	2	8	8277	8284	75 %	0 %	25 %	0 %	189485770
88	NS_000192	AATA	2	8	8326	8333	75 %	25 %	0 %	0 %	189485770
89	NS_000192	ACA	2	6	8413	8418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
90	NS_000192	ATT	2	6	8419	8424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485770
91	NS_000192	CAA	2	6	8426	8431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
92	NS_000192	CAA	3	9	8435	8443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
93	NS_000192	ACA	2	6	8446	8451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
94	NS_000192	AAC	3	9	8460	8468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
95	NS_000192	CAA	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
96	NS_000192	ACA	2	6	8500	8505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
97	NS_000192	AAC	3	9	8514	8522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
98	NS_000192	CAA	2	6	8546	8551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
99	NS_000192	AGAACA	2	12	8557	8568	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485770
100	NS_000192	ACA	3	9	8566	8574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
101	NS_000192	AAC	3	9	8577	8585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
102	NS_000192	GA	3	6	8635	8640	50 %	0 %	50 %	0 %	189485771
103	NS_000192	AT	3	6	8685	8690	50 %	50 %	0 %	0 %	189485771
104	NS_000192	TAAT	2	8	8745	8752	50 %	50 %	0 %	0 %	189485771
105	NS_000192	ATT	2	6	8771	8776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485771
106	NS_000192	A	6	6	8807	8812	100 %	0 %	0 %	0 %	189485771
107	NS_000192	A	6	6	8841	8846	100 %	0 %	0 %	0 %	189485771
108	NS_000192	GAAA	2	8	8899	8906	75 %	0 %	25 %	0 %	189485771
109	NS_000192	A	7	7	8904	8910	100 %	0 %	0 %	0 %	189485771
110	NS_000192	AAG	2	6	8931	8936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485771
111	NS_000192	AAG	2	6	8961	8966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485771
112	NS_000192	T	6	6	9022	9027	0 %	100 %	0 %	0 %	189485771
113	NS_000192	TTAC	2	8	9038	9045	25 %	50 %	0 %	25 %	189485771
114	NS_000192	TGT	2	6	9074	9079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485771
115	NS_000192	TTG	2	6	9091	9096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485771
116	NS_000192	A	6	6	9324	9329	100 %	0 %	0 %	0 %	189485772
117	NS_000192	TAT	2	6	9339	9344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485772
118	NS_000192	CTG	2	6	9364	9369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485772
119	NS_000192	TTG	2	6	9426	9431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485772
120	NS_000192	TATT	2	8	9444	9451	25 %	75 %	0 %	0 %	189485772
121	NS_000192	T	6	6	9458	9463	0 %	100 %	0 %	0 %	189485772
122	NS_000192	TCG	2	6	9479	9484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485772
123	NS_000192	TGG	2	6	9494	9499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189485772
124	NS_000192	ATA	2	6	9511	9516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485772
125	NS_000192	A	6	6	9558	9563	100 %	0 %	0 %	0 %	189485772
126	NS_000192	TGT	2	6	9602	9607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485772
127	NS_000192	CGTTT	2	10	9616	9625	0 %	60 %	20 %	20 %	189485772
128	NS_000192	TGT	2	6	9641	9646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485772
129	NS_000192	AAT	2	6	9648	9653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485772
130	NS_000192	A	7	7	10546	10552	100 %	0 %	0 %	0 %	189485773
131	NS_000192	GTT	2	6	10567	10572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485773
132	NS_000192	T	7	7	10571	10577	0 %	100 %	0 %	0 %	189485773
133	NS_000192	T	6	6	10582	10587	0 %	100 %	0 %	0 %	189485773
134	NS_000192	A	6	6	10597	10602	100 %	0 %	0 %	0 %	189485773
135	NS_000192	TCCCTG	2	12	10616	10627	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	189485773
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.